而这次明建州左卫军民镇抚使：爱新觉罗·舒尔哈齐，也一起前来，这是他第二次入京朝贡，也更加助长了他的野心。
在到达京城之后，两人都受到了朝廷隆重接待，并赏赐了许多的金银绸缎，其中明建州左卫军民指挥使在得知朝廷又一次发兵抗倭时，明建州左卫军民指挥使大义凛然地再次提出，要发兵支援。
但这次依旧被明神宗，给好言相劝拒绝了，不过看在他的忠心份上，已经镇守辽东都指挥使司女真各部也需要兵力，便赐封他为「龙虎将军」赏〈尚方宝剑〉。
而朝中官员有些担心建州左卫军民指挥使司做大？又加上建州右卫军民指挥使司与建州卫军民指挥使司暂无人管理！
于是明神宗为了制约明建州左卫军民指挥使，便授封明建州左卫军民镇抚使为「建州右卫军民指挥使」来做为一种战略对策，也算是尽力拉拢和收买效忠于大明帝国之人。
此事被明建州左卫军民指挥使看在眼里、恨在心里，两者间的矛盾瞬间激化。
不过明建州右卫军民指挥使：爱新觉罗·舒尔哈齐，却是非常的感激大明帝国恩宠，他决定誓死扞卫大明帝国，除了积极与大明发展密切关系之外，他还通过联姻把二女儿：爱新觉罗·额恩哲，嫁给明宁远伯：李成梁，次子明东征右副总兵：李如柏，为妾加强联系。
并且利用姻亲关系，与其它女真部落炫耀，用来扩大他个人的实力。
10月11日，明备倭总兵：麻贵，以明御倭总兵：李如梅，率领数千人攻向尚庆右道星州牧固城县，幕府从四位下筑后守：小早川秀包、幕府筑后三池：筑紫广门，负责死守城池。
但由于明军猛烈攻势，再加上探哨来报援军到达，之后两人商议决定趁夜突围去迎接幕府冈山藩左卫门督：小早川秀秋，派出的援军幕府从五位下玄藩头：山口正弘、幕府兵库头：南部无右卫门，汇合后转守为攻，重创明军。
使得明御倭总兵遂下令退去，因此被革职查办。
同时攻打忠清左道青山县的幕府第八军右军大将兼长府藩藩主：毛利秀元，等倭将则被明沈阳中卫左参将：彭友德、明沈阳中卫镇抚使：柴登科，率领的明、朝联军重兵包围，死伤惨重。
怎奈从尚庆左道蔚山都护府出来了的，幕府从五位下左京大夫：浅野幸长、幕府河内守：宍户元续、幕府丰后国藩主：太田一吉，等倭军将领接应，并掩护他们撤退。
10月26日，幕府倭军水师第一军伊势津藩主：藤堂高虎，则率领133余艘战船出发，欲趁涨潮时攻进鸣梁海峡，全歼李氏朝鲜水师。
结果李氏朝鲜三道水军统制使：李舜臣，首先将海峡内的民用船只侨装成战舰，以此来扰乱倭军，使其以为李氏朝鲜水师船队已经恢复过来。
他自己则亲率14艘战船引敌深入鸣梁海峡，在成功引诱倭军进攻后，李氏朝鲜三道水军统制使随即便发起了集中的攻击，对准倭军指挥舰攻去，结果歼灭了倭军指挥舰和其他战船2艘，并击毙幕府第四军水师河野家督大名：来岛通总。
同时间潮水开始退却，李氏朝鲜船只趁势进攻，倭军船只却因失去主帅，军心散涣，只得顺潮向东撤退。
但却遇上了李氏朝鲜三道水军统制使事先埋下的铁索和木桩，使其无法退却。
结果李氏朝鲜水师全力拼杀，击毙倭军十数人，击杀三岛水军的大将幕府风早郡领主：得居通年，并挫败倭军水师力量，史称「鸣梁海战」。
12月初1日，援朝明军追击倭军至尚庆左道蔚山都护府，各路明军接连获胜，倭军节节败退。
明万历二十六年公元1598年正月23日，明军开始攻打蔚山都护府，以明宣武卫游击将军：茅国器，率领的南军作为先锋，展开凌厉的攻势，并迅速突破了蔚山都护府城门，把幕府第一军左副将兼主计头：加藤清正，率领的军队围困在岛山城。
然而明都察院右佥都御史兼朝鲜经略：杨镐，却徇私将马上就要突入岛山城的南军部队，给换成辽东军前去攻城。
结果失败，丧失了最佳战机！
此时又因幕府第八军正三位参议：毛利秀元、幕府第三军甲裴守：黑田长政，等倭军的援兵突然赶至，让明军们大为震惊。
恰逢天又下起了大雨，明军火器无法使用，瞬间解了幕府第一军左副将部队之危难。
这时候明朝鲜经略又指挥失误，下令仓促撤军，策马率先赶奔京畿右道汉城府，明备倭总兵：麻贵，继而赶之，一时间大部分明军皆溃败。
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